Д-р Панайотов започва своя професионален път като уролог през 2002 г. в клиниката по урология на МБАЛ Св. Анна – Варна, където работи до 2008 г. Продължава лекарската си практика в Аджибадем Сити Клиник и участва като консултант-уролог в редица кампании за профилактика и ранна диагностика на доброкачествена простатна хипертрофия, уродинамика и бъбречно-каменна болест. Към момента д-р Панайотов практикува в Аджибадем Сити Клиник МЦ Варна, а от 2023 г. приема пациенти и в частния си кабинет на адрес: ул. Топра Хисар 20, Варна. Владее английски език.